الهدف من بناء جيش قوي بالجنوب بغية التمكين والحسم العسكري في الوقت المناسب الذي يتوجب فيه اتخاذ القرار الأخير في استكمال تحرير بقية مناطق الجنوب وفرض الأمر الواقع باعتبار الخيار الوحيد لدى المجلس الانتقالي الجنوبي لاستعادة الدولة الجنوبية كما كانت ما قبل العام( 1990 )هو فرض السيطرة على الأرض عسكريٌا في ربوع الجنوب عامة واعلان الدولة المدنية الحديثة.
و يولي المجلس الانتقالي الجنوبي القوات المسلحة الجنوبية بمختلف التشكيلات العسكرية والأمنية اهتمام خاص من خلال عملية التأهيل والتدريب ،وصقل منتسبو الجيش والأمن المهارات القتالية واكتساب الخبرات وتزويدهم بالمعارف والمفاهيم التي تعزز من القدرات القتالية إلى جانب رفد الطلاب بالكليات العسكرية والحربية سواءً داخليًا أو خارجيًا
